Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra6P16305 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms