Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms