Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb1P13372 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms