Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nr4a1P12813 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nr4a1P12813 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms