Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd4P10628 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms