Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsbP10605 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtsbP10605 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms