Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Amd1P0DMN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Amd1P0DMN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms