Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UbbP0CG49 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UbbP0CG49 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms