Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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