Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csf3P09920 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms