Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb5P09079 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxb5P09079 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms