Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd3P09027 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd3P09027 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd3P09027 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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