Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa1P09022 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa1P09022 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa1P09022 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms