Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spta1P08032 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spta1P08032 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms