Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms