Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9P06683 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9P06683 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9P06683 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9P06683 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P06683 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P06683 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9P06683 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P06683 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P06683 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P06683 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P06683 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9P06683 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9P06683 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9P06683 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9P06683 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms