Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hbb-bh1P04444 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hbb-bh1P04444 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms