Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lamb1P02469 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamb1P02469 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamb1P02469 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms