Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-K1P01901 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms