Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abl1P00520 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abl1P00520 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abl1P00520 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms