Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AfmO89020 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AfmO89020 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AfmO89020 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AfmO89020 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AfmO89020 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AfmO89020 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AfmO89020 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
AfmO89020 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AfmO89020 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AfmO89020 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AfmO89020 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AfmO89020 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AfmO89020 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms