Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcnkO88874 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcnkO88874 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms