Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BlmO88700 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
BlmO88700 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BlmO88700 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BlmO88700 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BlmO88700 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BlmO88700 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BlmO88700 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BlmO88700 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BlmO88700 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BlmO88700 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BlmO88700 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BlmO88700 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BlmO88700 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BlmO88700 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BlmO88700 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BlmO88700 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BlmO88700 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BlmO88700 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BlmO88700 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BlmO88700 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BlmO88700 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BlmO88700 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BlmO88700 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BlmO88700 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BlmO88700 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BlmO88700 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BlmO88700 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BlmO88700 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BlmO88700 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BlmO88700 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BlmO88700 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms