Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3fO88632 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3fO88632 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms