Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ComtO88587 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ComtO88587 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ComtO88587 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ComtO88587 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ComtO88587 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ComtO88587 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ComtO88587 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ComtO88587 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ComtO88587 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ComtO88587 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ComtO88587 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ComtO88587 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ComtO88587 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ComtO88587 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ComtO88587 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ComtO88587 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ComtO88587 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ComtO88587 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ComtO88587 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ComtO88587 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ComtO88587 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ComtO88587 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ComtO88587 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ComtO88587 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms