Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sap30O88574 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sap30O88574 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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