Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vti1bO88384 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vti1bO88384 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms