Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnt1O88346 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnt1O88346 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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