Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ly86O88188 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms