Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CtssO70370 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CtssO70370 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CtssO70370 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CtssO70370 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtssO70370 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CtssO70370 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CtssO70370 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CtssO70370 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CtssO70370 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CtssO70370 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtssO70370 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms