Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtogO55225 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtogO55225 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OtogO55225 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OtogO55225 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OtogO55225 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OtogO55225 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OtogO55225 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OtogO55225 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OtogO55225 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms