Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt5hO55201 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt5hO55201 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms