Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx4O55187 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx4O55187 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms