Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap2O55126 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nipsnap2O55126 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nipsnap2O55126 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms