Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PrxO55103 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PrxO55103 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PrxO55103 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PrxO55103 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PrxO55103 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PrxO55103 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrxO55103 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrxO55103 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PrxO55103 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PrxO55103 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PrxO55103 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PrxO55103 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrxO55103 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrxO55103 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrxO55103 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrxO55103 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrxO55103 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrxO55103 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms