Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngr2O55101 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms