Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mef2bO55087 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms