Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nck2O55033 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nck2O55033 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms