Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc3O55013 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc3O55013 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms