Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarce1O54941 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarce1O54941 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms