Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a2O54833 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Csnk2a2O54833 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms