Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr6O54689 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms