Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FxnO35943 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FxnO35943 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FxnO35943 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FxnO35943 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FxnO35943 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FxnO35943 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FxnO35943 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FxnO35943 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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FxnO35943 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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