Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl25O35903 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl25O35903 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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