Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited2O35740 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms