Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf18O35714 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf18O35714 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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