Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stag2O35638 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stag2O35638 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms