Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema6aO35464 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms