Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrcpO35427 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CrcpO35427 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrcpO35427 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrcpO35427 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrcpO35427 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms