Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppef2O35385 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppef2O35385 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms